Od svého založení v roce 2004 EPMA spolupracuje s širokým spektrem partnerů a organizací z celé Evropy. Spolupracujeme s výzkumnými institucemi, univerzitami a vysokými školami. Mezi nejvýznamnější patří Masarykova univerzita v Brně, Univerzita Karlova v Praze, University of Groningen (NL), Leibniz University Hannover (DE), Krakow University of Economics (PL), a University of Vienna (AT).
EPMA spolupracuje s experty z národních vlád, ministerstev a jiných veřejných institucí států EU. Na unijní úrovni patří mezi naše časté partnery Evropská komise a její instituty a výbory Evropského parlamentu.
Spolupracujeme rovněž s agenturami podporujícími regionální rozvoj a podnikání, obchodními komorami a jinými neziskovými sdruženími jako jsou Hospodářská komora v Jihlavě, Austrian Computer Society, MFG Public Innovation Agency for IT and Media (DE), Danish Technological Institute (DK) nebo La Fonderie (FR).
Jsme členy nebo trvale udržujeme vazby s evropskými sítěmi, jako jsou ELANET, CEMR, a EUROCITIES. Na regionální úrovni jsme propojeni s více jak 50 evropskými regiony, s většinou z nich jsme společně realizovali některé z našich projektů. Mezi nejvýznamnější patří National Assembly for Wales (UK) nebo Region Piemont (IT). EPMA spolupracuje i se spolky zastřešujícími místní státní správu a samosprávu. V ČR se jedná o Svaz měst a obcí ČR, v Evropě např. Svaz italských municipalit a Sdružení baskických měst a obcí.
Díky organizaci tematických evropských konferencí (např. Eastern European eGovernment Days, ONE Conference v Bruselu a Praze) jsme propojeni s širokou paletou expertů ze státní správy, byznysu a akademického prostředí. Od roku 2016 spolupracujeme observatoří GIP Digital Watch, která se specializuje na poskytování informačního servisu v oblasti správy internetu.